正式版 GB/T 43166-2023 燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法.pdf

多态性,其他规范
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ICS65.020.20 CCS B16 GB 中华人民共和国国家标准 GB/T43166—2023 燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法 Traceability detection of Acidovorax avenae subsp.citrulli 2023-09-07发布 2024-04-01实施 国家市场监督管理总局 国家标准化管理委员会 发布 GB/T43166—2023 前言 本文件按照GB/T1.1一2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定 起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任. 本文件由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口. 本文件起草单位:中华人民共和国深圳海关、深圳市检验检疫科学研究院、中国农业大学. 本文件主要起草人:章桂明、高瑞芳、王颖、向才玉、黄河清、李娜、张丹丹. I GB/T43166—2023 燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法 1范围 本文件描述了应用全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)方法对燕麦嗜酸菌西瓜亚种进行溯源检测 的方法. 本文件适用于燕麦嗜酸菌西瓜亚种的分子溯源检测. 2规范性引用文件 本文件没有规范性引用文件. 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 溯源traceability 对于一个未知产地的对象,依靠建立特定的技术,实现其原产地的追溯. 注:溯源又称为“可追湖性”. 3.2 系统发育树phylogenetic tree 具有共同祖先的各物种间进化关系的树. 注:在进化树中,每个分支节点代表其各分支的最近共同祖先,而节点间的线段长度对应演化距离. 3.3 单核苷酸多态性single nucleotide polymorphism;SNP 在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性. 3.4 全基因组单核苷酸多态性whole genome single nucleotide polymorphism;wgSNP 在全基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性. 4病菌的基本信息 中文名:燕麦嗜酸菌西瓜亚种,又称瓜类果斑病菌、西瓜细菌性果斑病菌、西瓜细菌性果腐病菌. 学名:Acidovorax avenae subsp.citrulli(Schaad et al. 1978)Willems et al. 1992 最新命名:Acidovorax citrulli(Schaad et al.)Schaad et al. 2O08 异名:Pseudomonas avenae subsp.citrulli(Schaad et al. 1978)Hu et al. 1991 Pseudomonas pseudoalcaligenes subsp.citrulli Schaad et al. 1978 分类地位:原核生物界(Procaryotae) 变形菌门(Proteobacteria) B-变形菌纲(Betaproteobacteria) 从毛 单胞菌科(Comamonadaceae) 噬酸菌属(Acidovorax) 西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.citrulli). 该病菌的其他相关资料见附录A. 1 ...

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