SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.1-2017 基因条形码筛查方法 第1部分:检疫性棒形杆菌 DNA barcoding screening method-Part 1:Quarantine Clavibacter spp. 2017-07-21发布 2018-03-01实施 中华人民共和国 国家质量监督检验检疫总局 发布 SN/T4877.1-2017 前言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》共分为3个部分: ——第1部分:检疫性棒形杆菌; —第2部分:检疫性黄单胞菌; ——第3部分:检疫性植原体. 本部分为SN/T4877的第1部分. 本部分按照GB/T1.1一2009给出的规则起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任. 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口. 本部分起草单位:中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国黄岛出入境检验检疫局、中华人民共 和国北京出入境检验检疫局、中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、中华人民共和国天津出入境检验 检疫局. 本部分主要起草人:赵文军、夏明星、张凤娟、田茜、高文娜、冯建军、廖芳. SN/T4877.1-2017 基因条形码筛查方法 第1部分:检疫性棒形杆菌 1范围 SN/T4877的本部分规定了检疫性棒形杆菌DNA条形码筛查中序列的扩增、分析及结果判定等. 本部分适用于检疫性棒形杆菌的筛查. 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件. SN/T1135.5马铃薯环腐病菌检疫鉴定方法 SN/T2568番茄细菌性溃疡病菌检疫鉴定方法 SN/T2666苜蓿细菌性萎蔫病菌检疫鉴定方法 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 DNA条形码 生物体内能够代表该物种的,标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段. 3.2 16 S rRNA基因 原核生物核糖体30S小亚基的组成部分.在细菌的进化过程中,16SRNA基因的进化相对保 守,被认为是衡量生命进化历史最理想的标尺,基因序列具有高度的保守性和特异性. 16SRNA基因序列是细菌检测鉴定与分类研究中应用最多的基因序列,是细菌种间鉴定的重要 依据. 3.3 gyrB基因 编码DNA解旋酶B亚单位的基因,是单拷贝的看家基因,普遍存在于各种细菌中,本部分中gyrB 基因序列作为细菌条形码基因进行种及种下阶元的筛查鉴定. 4棒形杆菌的基本信息 学名:Clavibacter 分类地位:细菌界(Bacteria) 放线菌门(Actinobacteria) 放线菌纲(Actinobacteria) 放线菌目 (Actinomycetales) 微杆菌科(Microbacteriaceae).目前棒形杆菌属的植物病原细菌只有一个种一一 密执安棒形杆菌(Clavibacter michiganensis) 该种包括如下5个亚种,其中前4个为进境植物检疫性 有害生物: 1 ...