SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.10-2017 基因条形码筛查方法 第10部分:检疫性疫霉 DNA barcoding screening method-Part 10:Quarantine Phytophthora 2017-08-29发布 2018-04-01实施 中华人民共和国 国家质量监督检验检疫总局 发布 SN/T4877.10-2017 前 言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》分为10部分: ——第1部分:检疫性棒形杆菌; ——第2部分:检疫性黄单胞菌; ——第3部分:检疫性植原体; —第4部分:检疫性茎点霉; 第5部分:检疫性拟茎点霉; 第6部分:检疫性嗜酸菌; —第7部分:检疫性轮枝菌; ——第8部分:检疫性炭疽菌; ——第9部分:检疫性腥黑粉菌; ——第10部分:检疫性疫霉. 本部分为SN/T4877的第10部分. 本部分按照GB/T1.1一2009给出的规则起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任. 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口. 本部分起草单位:中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、深圳市检验检疫科学研究院. 本部分起草人:章桂明、高瑞芳、汪莹、程颖慧、王颖、黄河清. I SN/T4877.10-2017 基因条形码筛查方法 第10部分:检疫性疫霉 1范围 SN/T4877的本部分规定了栗疫霉黑水病菌、马铃薯疫霉绯腐病菌、草莓疫霉红心病菌、树莓疫霉 根腐病菌、柑橘冬生疫霉、雪松疫霉根腐病菌、苜蓿疫霉根腐病菌、菜豆疫霉病菌、栎树猝死病菌、大豆疫 霉病菌和丁香疫霉病菌的DNA条形码筛查. 本部分适用于栗疫霉黑水病菌、马铃薯疫霉绯腐病菌、草莓疫霉红心病菌、树莓疫霉根腐病菌、柑橘 冬生疫霉、雪松疫霉根腐病菌、苜蓿疫霉根腐病菌、菜豆疫霉病菌、栎树猝死病菌、大豆疫霉病菌和丁香 疫霉病菌的DNA条形码筛查种序列的扩增、分析及结果判定等. 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件. SN/T1131大豆疫霉病菌检疫鉴定方法 SN/T1135.6马铃薯绯腐病菌检疫鉴定方法 SN/T2080栎树猝死病菌检疫鉴定方法 SN/T2474大豆疫霉病菌实时荧光PCR检测方法 SN/T2617冬生疫霉病菌检疫鉴定方法 SN/T2756丁香疫霉检疫鉴定方法 SN/T2759 栗黑水疫霉病菌检疫鉴定方法 SN/T3403菜豆疫霉检疫鉴定方法 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 DNA条形码DNA barcode 生物体内能够代表该物种的,标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段. 3.2 线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I COI 线粒体基因变化速率快,在其13个蛋白编码基因中,COI基因很少存在插入缺失,序列长度500bp~ 7O0bp 宜作为真菌DNA条形码,也是最早提出的DNA条形码片段. 3.3 内部转录间隔区序列internal transcribed spacer;ITS 在真核生物中,核糖体DNA是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成,其基因组序列从5’到3’ 依次为:外部转录间隔区、18S基因、内部转录间隔区1(1TS1)、5.8S基因、内部转录间隔区2(ITS2)、 28S基因和基因间隔序列.内部转录间隔区是...