SN/T 4877.3-2017 基因条形码筛查方法 第3部分：检疫性植原体.pdf

SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.3-2017 基因条形码筛查方法 第3部分：检疫性植原体 DNA barcoding screening method- Part 3:Quarantine phytoplasma 2017-07-21发布 2018-03-01实施 中华人民共和国发布 国家质量监督检验检疫总局 SN/T4877.3-2017 前言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》共分为3个部分： ——第1部分：检疫性棒形杆菌； —第2部分：检疫性黄单胞菌； ——第3部分：检疫性植原体. 本部分为SN/T4877的第3部分. 本部分按照GB/T1.1一2009给出的规则起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任. 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口. 本部分起草单位：中国检验检疫科学研究院、中国农业科学院生物技术研究所、中华人民共和国广 西出入境检验检疫局、福建省农业科学院、中华人民共和国天津出入境检验检疫局. 本部分主要起草人：赵文军、李为民、杜智新、谢丽雪、田茜、廖芳. SN/T4877.3-2017 基因条形码筛查方法 第3部分：检疫性植原体 1范围 SN/T4877的本部分规定了检疫性植原体DNA条形码筛查方法中DNA提取、基因扩增、序列的 比对分析及结果判定等. 本部分适用于检疫性植原体的筛查鉴定. 2术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 2.1DNA条形码 生物体内能够代表该物种的，标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段. 2.216 SrRNA基因 原核生物核糖体30S小亚基的组成部分.在细菌的进化过程中，16SRNA基因的进化相对保守， 被认为是衡量生命进化历史最理想的标尺，16SRNA基因序列具有高度的保守性和特异性，在植原体 的分类鉴定中广泛应用. 2.3tuf基因 延伸因子基因，是植原体转录过程中的关键因子、为单拷贝，序列相对保守，常用于植原体的分类 鉴定. 3植原体基本信息 为软壁菌门(Tendericutes) 柔膜菌纲(Mollicuteria) 菌原体目(Mycoplasmatales) 非醇原体科 (Acholeplasmataceae) 植原体候选属(Candidatus phytoplasma).检疫性植原体的具体信息参见附 录A. 4方法原理 16 S rRNA基因序列、虚拟的RFLP图谱及tuf基因序列是本部分中检疫性植原体筛查鉴定的主 要依据.依据DNA序列分析结果与生物学信息进行最终结果判定. 5仪器用具及试剂 5.1仪器用具 PCR仪、超净工作台、灭菌锅、制冰机、核酸蛋白分析仪、高速冷冻离心机，台式小型离心机、冰箱、 1 ...