SN/T 4877.4-2017 基因条形码筛查方法 第4部分：检疫性茎点霉.pdf

SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.4-2017 基因条形码筛查方法 第4部分：检疫性茎点霉 DNA barcoding screening method-Part 4:Quarantine Phoma spp. 2017-08-29发布 2018-04-01实施 中华人民共和国 国家质量监督检验检疫总局 发布 SN/T4877.4—2017 前言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》分为10个部分： —第1部分：检疫性棒形杆菌； ——第2部分：检疫性黄单胞菌； ——第3部分：检疫性植原体； —第4部分：检疫性茎点霉； ——第5部分：检疫性拟茎点霉； ——第6部分：检疫性嗜酸菌； ——第7部分：检疫性轮枝菌； ——第8部分：检疫性炭疽菌； ——第9部分：检疫性腥黑粉菌； ——第10部分：检疫性疫霉. 本部分为SN/T4877的第4部分. 本部分按照GB/T1.1一2009给出的规则起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任. 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口. 本部分起草单位：中华人民共和国宁波出入境检验检疫局、中国科学院微生物研究所、中华人民共 和国天津出入境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院. 本部分起草人：段维军、蔡磊、陈倩、廖芳、郭立新、张慧丽、陈先锋、朱水芳. SN/T4877.4-2017 基因条形码筛查方法 第4部分：检疫性茎点霉 1范围 SN/T4877的本部分规定了检疫性茎点霉DNA条形码筛查方法. 本部分适用于进境植物及其产品中检疫性茎点霉的筛查. 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文 件.凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括的修改单）适用于本文件. SN/T1135.8马铃薯环疽病菌检疫鉴定方法 SN/T2589植物病原真菌检测规范 SN/T3288柠檬干枯病菌检疫鉴定方法 SN/T3682葡萄茎枯病菌检疫鉴定方法 SN/T3755豌豆脚腐病菌检疫鉴定方法 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 DNA条形码DNA barcode 生物体内能够代表该物种的，标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段. 3.2 内部间隔转录区序列internal transcribed spacer;ITS 在真核生物中，核糖体DNA是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成，其基因组序列从5'~3'依 次为：外部转录间隔区、18S基因、内部转录间隔区1(ITS1)、5.8S基因、内部转录间隔区2(ITS2)28S 基因和基因间隔序列.内转录间隔区是存在于18 S rDNA、5.8 S rDNA和28 S rDNA之间的区域， ITS1和ITS2作为非编码区，受外界环境因素的影响较小，与编码区域相比具有进化速度快的特点，在 种内的不同菌株之间高度保守，而在真菌种间存在极大的变化，表现出极大的序列多态性，能够提供详 尽的系统学分析所需的可遗传性状. 3.3 B-微管蛋白基因beta-tubulin TUB 微管蛋白基因既有保守的外显子又有许多内含子，已被用于真菌各级分类水平上的系统发育研 究.并且发现其无论在低分类阶元的系统发育研究中，还是复合种的研究中，甚至对于种内不同地域菌 株间的亲缘关系研究有重要意义.微管蛋白基因已在茎点霉属部分物种的研究中显示出较好的区分 程度. 1 ...