SN/T 4877.6-2017 基因条形码筛查方法 第6部分：检疫性嗜酸菌.pdf

SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.6-2017 基因条形码筛查方法 第6部分：检疫性嗜酸菌 DNA barcoding screening method-Part 6:Quarantine Acidovorax spp. 2017-08-29发布 2018-04-01实施 中华人民共和国发布 国家质量监督检验检疫总局 SN/T4877.6-2017 前言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》分为10部分： ——第1部分：检疫性棒形杆菌； ——第2部分：检疫性黄单胞菌； —第3部分：检疫性植原体； —第4部分：检疫性茎点霉； —第5部分：检疫性拟茎点霉； ——第6部分：检疫性嗜酸菌； ——第7部分：检疫性轮枝菌； —第8部分：检疫性炭疽菌； —第9部分：检疫性腥黑粉菌； ——第10部分：检疫性疫霉. 本部分为SN/T4877的第6部分. 本部分按照GB/T1.1一2009给出的规则起草. 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口. 本部分起草单位：中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、深圳市检验检疫科学研究院、中国检验 检疫科学研究院. 本部分主要起草人：冯建军、赵文军、田茜、汪莹、龙海、程颖慧、郑耘、章桂明、陈枝楠. SN/T4877.6-2017 基因条形码筛查方法 第6部分：检疫性嗜酸菌 1范围 SN/T4877的本部分规定了Acidovorax citrulli、Acidovorax cattleyae和Acidovorax konjaci三 种检疫性嗜酸菌的DNA条形码筛查中序列的扩增、分析及结果判定等. 本部分适用于Acidovorax citrulli、Acidovorax cattleyae和Acidovorax konjaci三种检疫性嗜酸 菌的筛查. 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文 件.凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括的修改单）适用于本文件. SN/T1465西瓜细菌性果斑病菌检疫鉴定方法 SN/T3681魔芋细菌性叶斑病菌检疫鉴定方法 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 DNA条形码DNA barcode 生物体内能够代表该物种的，标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DA片段. 3.2 内部转录间隔区internal transcribed spacer;ITS 在rDNA基因中，位于保守16S和23 S rDNA间隔区之间的序列，包括部分tRNA基因和一些非 编码区，由于进化选择压力较小，ITS序列比16S和23 S rDNA序列本身的变异性更大，因此，ITS适合 用于细菌种下不同群体的特异性检测与鉴定. 4嗜酸菌的基本信息 学名：Acidovorax 分类地位：细菌界(bacteria) 薄壁菌门(Gracilicutes)假单胞菌科(Pseudomonaceae)嗜酸菌属 (Acidovorax) 属rRNA组I.目前植物性嗜酸菌有5个种，其中前3个为进境植物检疫性有害生物. 瓜类细菌性果斑病菌Acidovorax citrulli(Schaad et al.1978)Schaad et al.2008 兰花褐斑病菌Acidovorax cattleyae(Pavarino1911)Schaad et al.2008 魔芋细菌性叶斑病菌Acidovorax konjaci(Willems et al.1992) 燕麦嗜酸菌Acidovorax avenae(Manns1909)Wille...