SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.7-2017 基因条形码筛查方法 第7部分:检疫性轮枝菌 DNA barcoding screening method-Part 7:Quarantine Verticillium 2017-08-29发布 2018-04-01实施 中华人民共和国 国家质量监督检验检疫总局 发布 SN/T4877.7-2017 前言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》分为10部分: ——第1部分:检疫性棒形杆菌; ——第2部分:检疫性黄单胞菌; ——第3部分:检疫性植原体; ——第4部分:检疫性茎点霉; ——第5部分:检疫性拟茎点霉; —第6部分:检疫性嗜酸菌; —第7部分:检疫性轮枝菌; ——第8部分:检疫性炭疽菌; —第9部分:检疫性腥黑粉菌; ——第10部分:检疫性疫霉. 本部分为SN/T4877的第7部分. 本部分按照GB/T1.1一2009给出的规则起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任. 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口. 本部分起草单位:中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、深圳市检验检疫科学研究院. 本部分起草人:高瑞芳、章桂明、汪莹、程颖慧、王颖、卢小雨、向才玉、潘广. SN/T4877.7-2017 基因条形码筛查方法 第7部分:检疫性轮枝菌 1范围 SN/T4877的本部分规定了棉花黄萎病菌和苜蓿黄萎病菌DNA条形码筛查中序列的扩增、分析 及结果判定等. 本部分适用于检疫性轮枝菌的DNA条形码筛查. 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件. GB/T28084棉花黄萎病菌检疫检测与鉴定 SN/T1145苜蓿黄萎病检疫鉴定方法 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 DNA条形码DNA barcode 生物体内能够代表该物种的,标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段. 3.2 内部转录间隔区序列internal transcribed spacer;ITs 在真核生物中,核糖体DNA是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成,其基因组序列从5’到3’ 依次为:外部转录间隔区、18S基因、内部转录间隔区1(ITS1)、5.8S基因、内部转录间隔区2(ITS2)、 28S基因和基因间隔序列.内转录间隔区是存在于18 S rDNA、5.8 S rDNA和28 S rDNA之间的区 域,ITS1和ITS2作为非编码区,受外界环境因素的影响较小,与编码区域相比具有进化速度快的特点, 在种内的不同菌株之间高度保守,而在真菌种间存在极大的变化,表现出极大的序列多态性,能够提供 详尽的系统学分析所需的可遗传性状 4检疫性轮枝菌基本信息 学名:Verticillium dahliae Kleb 中文名:棉花黄萎病菌 学名:Verticillium albo-atrum Reinke et Berthold 中文名:苜蓿黄萎病菌 分类地位:真菌界(Fungi) 丝孢纲(Hyphomycetes) 丝孢目(Hyphomycetales) 淡色孢科(Monili- aceae) 轮枝孢属(Verticillium) 寄主范围参见附录A. 5方法原理 使用ITS片段作为棉花黄萎病菌和苜蓿黄萎病菌的DNA条形码基因,通过对检测对象的DNA进 1 ...
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