SN/T 4877.8-2017 基因条形码筛查方法 第8部分：检疫性炭疽菌.pdf

SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T4877.8-2017 基因条形码筛查方法 第8部分：检疫性炭疽菌 DNA barcoding screening method-Part 8:Quarantine colletotrichum kahawae 2017-08-29发布 2018-04-01实施 中华人民共和国发布 国家质量监督检验检疫总局 SN/T4877.8-2017 前言 SN/T4877《基因条形码筛查方法》分为10个部分： ——第1部分：检疫性棒形杆菌； 第2部分：检疫性黄单胞菌； ——第3部分：检疫性植原体； 第4部分：检疫性茎点霉； 第5部分：检疫性拟茎点霉； 第6部分：检疫性嗜酸菌； —第7部分：检疫性轮枝菌； ——第8部分：检疫性炭疽菌； ——第9部分：检疫性腥黑粉菌； ——第10部分：检疫性疫霉. 本部分为SN/T4877的第8部分. 本部分按照GB/T1.1一2009给出的规则起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任. 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口. 本部分起草单位：中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、深圳市检验检疫科学研究院、中华人民 共和国宁波出入境检验检疫局. 本部分主要起草人：程颖慧、章桂明、高瑞芳、王颖、史亚千、汪莹、段维军、向才玉、潘广、王红英、 谢晓露. 1 SN/T4877.8-2017 基因条形码筛查方法 第8部分：检疫性炭疽菌 1范围 SN/T4877的本部分规定了咖啡浆果炭疽病菌Colletotrichum kahawae DNA条形码筛查中序 列的扩增、分析及结果判定等. 本部分适用于进境植物及植物产品中咖啡浆果炭疽病菌的DA条形码的筛查. 2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文 件.凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括的修改单）适用于本文件. SN/T3679咖啡浆果炭疽病菌检疫鉴定方法 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 DNA条形码DNA barcode 生物体内能够代表该物种的，标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段. 3.2 甘油醛-3-磷酸脱氢酶glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase;GAPDH 糖酵解反应中的一个酶，分子量46kDa 为管家基因，几乎在组织中都高水平表达.在同种 细胞或者组织中的蛋白质表达量一般是恒定的，且不受含有的部分识别位点、佛波脂等的诱导物质的影 响而保持恒定. 4咖啡浆果炭疽病菌的基本信息 英文名：pathogen of coffee berry disease 学名：Colletotrichum kahawae J.M.Waller et Bridge 异名：Colletotrichum coffeanum var.virulans(Rayner 1952) 分类学地位：真菌界(Fungi) 无性型真菌(Anamorphic fungi) 炭疽菌属(Colletotrichum). 5方法原理 使用GAPDH基因作为咖啡浆果炭疽病菌的DNA条码基因，通过对检测对象的DNA进行PCR 扩增及产物测序后，利用NCBI核酸数据库比对，根据序列相似度筛查物种. 1 ...