ICS65.020.20 CCS B 16 中华人民共和国国家标准 GB/T43166-2023 燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法 Traceability detection of Acidovorax avenae subsp.citrulli 2023-09-07发布 2024-04-01实施 国家市场监督管理总局 国家标准化管理委员会 发布 GB/T43166-2023 前言 本文件按照GB/T1.1一2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定 起草. 请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任. 本文件由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口. 本文件起草单位：中华人民共和国深圳海关、深圳市检验检疫科学研究院、中国农业大学. 本文件主要起草人：章桂明、高瑞芳、王颖、向才玉、黄河清、李娜、张丹丹. I GB/T43166-2023 燕麦嗜酸菌西瓜亚种溯源检测方法 1范围 本文件描述了应用全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)方法对燕麦嗜酸菌西瓜亚种进行溯源检测 的方法. 本文件适用于燕麦嗜酸菌西瓜亚种的分子溯源检测. 2规范性引用文件 本文件没有规范性引用文件. 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 溯源traceability 对于一个未知产地的对象，依靠建立特定的技术，实现其原产地的追溯. 注：溯源又称为“可追溯性”. 3.2 系统发育树phylogenetic tree 具有共同祖先的各物种间进化关系的树. 注：在进化树中，每个分支节点代表其各分支的最近共同祖先，而节点间的线段长度对应演化距离. 3.3 单核苷酸多态性single nucleotide polymorphism;SNP 在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性. 3.4 全基因组单核苷酸多态性whole genome single nucleotide polymorphism;wgSNP 在全基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性. 4病菌的基本信息 中文名：燕麦嗜酸菌西瓜亚种，又称瓜类果斑病菌、西瓜细菌性果斑病菌、西瓜细菌性果腐病菌. 学名：Acidovorax avenae subsp.citrulli(Schaad et al. 1978)Willems et al. 1992 最新命名：Acidovorax citrulli(Schaad et al.)Schaad et al. 2008 异名：Pseudomonas avenae subsp.citrulli(Schaad et al. 1978)Hu et al. 1991 Pseudomonas pseudoalcaligenes subsp.citrulli Schaad et al. 1978 分类地位：原核生物界(Procaryotae) 变形菌门(Proteobacteria) B-变形菌纲(Betaproteobacteria) 从毛 单胞菌科(Comamonadaceae) 噬酸菌属(Acidovorax) 西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.citrulli). 该病菌的其他相关资料见附录A. 1 ...
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