ICS 07.060 A 45 HY 中华人民共和国海洋行业标准 HY/T0295-2020 海绵种属分子鉴定技术规程 Specification of identifying sponge based on molecular data 2020-06-28发布 2020-10-01实施 中华人民共和国自然资源部 发布
HY/T0295-2020 前言 本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草.
本标准由中华人民共和国自然资源部提出.
本标准由全国海洋标准化技术委员会(SAC/TC283)归口.
本标准起草单位:大连海洋大学、中国科学院大连化学物理研究所、大连金普新区农业农村发展服 务中心.
本标准主要起草人:付晚涛、曹旭鹏、杜萌萌、苏廷明、王刚、吴孟嘉、张世杰、李东子、沈思思、 丁小涵、王玄、肖一帆、王少杰、鲁艳莉、李晶莹.
HY/T 0295-2020 海绵种属分子鉴定技术规程 1范围 本标准规定了海绵种属分子生物学鉴定的原理与方法、海绵样品采集与保存.
本标准适用于海绵的样品采集、保存和分子生物学方法种属鉴定.
2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.
凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件.
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
GB/T12763.6-2007海洋调查规范第6部分:海洋生物资源调查 GB/T30744-2014深海微生物样品前处理技术规范 HY/T058-2010海洋调查观测监测档案业务规范 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件.
3.1 海绵sponge 目前已知仍然生存的最古老、最低等的多细胞动物,在动物界中单独构成多孔动物门.
3.2 DNA条形码DNAbarcode 生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段,用于快速准 确识别、鉴定物种.
3.3 海绵条形码sponge barcode 海绵的保守基因序列信息的一种表述形式.
3.4 18S rRNA 基因18S rRNA gene 编码18SrRNA基因的DNA序列.
3.5 细胞色素氧化酶亚基Icytochrome oxidase subunitI 编码线粒体细胞色素氧化酶亚基I(Cytochrome oxidase subunitI)基因的DNA序列.
注:以下简称COI 3.6 聚合酶链式反应polymerase chainreaction DNA模板先经高温变性为单链,在适宜温度下和缓冲液中,两条引物分别与模板DNA两条链上 的一段互补序列发生退火,接着在DNA聚合酶催化下以四种dNTP为底物,使退火引物得以延伸,如 此反复变性、退火和延伸,使位于两段引物序列之间的DNA片段呈几何倍数扩增.
HY/T 0295-2020 4原理 通过聚合酶链式反应(简称PCR)分别扩增海绵的18SrDNA和COIDNA的部分序列,测序获得 各自序列信息后分别与已经鉴定的海绵18SrDNA和COIDNA序列比对,以此鉴定海绵种属.
5仪器与设备 5.1野外生物样品保存箱或保温箱.
5.2低温冰箱.
5.3研体.
5.5水浴锅.
5.6高速低温冷冻享 心机.
5.7 紫外分光光度 计.
5.8 聚合酵链式 成反应 DNA扩增仪(简称PCR仪).
5.9电泳仪.
5.10高压 菌钢 5.11酒精 5.12液氢 罐. 6试剂与材料 注:除非另有规定:使用试剂均发 步析线 6.1无水2醇.
6.270%乙.
6.3液氮.
6.4异丙醇.
6.5浓硝酸或浓盐酸.
6.6浓硫酸. 6.7 蒸馏水或去离子水 6.8蛋白酶K. 6.9Taq酶.
6.10琼脂糖.
6.11 醋酸钾溶液(配方见附录A).
6.12 细胞裂解缓冲液(配方见附录A).
6.13TE缓冲液(pH7.6)(配方见附录A).
6.14 10XPCR缓冲液(配方见附录A). 6.15 吸管.
6.16 载玻片.
6.17 采样袋或采样瓶.
6.18 聚丙烯离心管.
HY/T 0295-2020 7海绵样品采集与保存 7.1海绵样品采集 首先,对于海绵及其周围环境,先拍照或摄像;此外,按照GB/T12763.6-2007中10.2规定执行.
7.2海绵样品保存 7.2.1暂时保存 保存箱,有条件时,直接放人冰箱冷藏保存,保存时间1天 7.2.2短期保存 暂时保存在无水乙醇中1天海绵样品,需要更换全部无水乙醇,然后冷涂保存周.
7.2.3长期保存 暂时保存在无水乙醇中1天海绵样品或采集海丝样品需要转称至一20C保存.
在一20C保存约 2周时间,需要更换全部无水乙醇乙停加大量与海绵样品的体积比同样为(15):1然后可继续放在 -20C保存在一20C继续保存药3个月,需要重换全部无水么醇热后继线放在一20保存.
由 此,在一20C条件,可以按此方法连续保存1 7.3海绵样品记录 海绵样品采集与保存记录主高绵资源调查采样表 见附 8海绵种属分子生物学鉴定方法 8.1海绵DNA提取与练化 8.1.1取出保存在乙醇中的海绵样品,在样品几何中心部位取样品约0.5 放人事 先用液氮预冷的研 体中,加人液氮研磨海绵样品成稳末状.
8.1.2将上述研磨成粉末的海绵样品量约1/5移人装有600pL细胞数解缓冲液的聚丙烯离心管中混 匀,加人3μL蛋白酶K,在55C水浴锅上放置3h.
8.1.3从水浴钢取下装有海绵的离心管,在室温加人200pi醋酸钾溶液,振荡、混匀. 8.1.4将步骤8.1.3的离心管在4C、10000g离心力条件下离心3min,然后将上清液转移至装有 600uL异丙醇的1个新的聚丙烯离心管中,振荡、混匀, 8.1.5将步骤8.1.4的离心管在室湿、10000g离心力条件下离心3min,然后吸去上清液,加人600gL 乙醇(70%),振荡、混匀. 8.1.6将步骤8.1.5的离心管在室温、10000g离心力条件下离心3min,弃上清液.
8.1.7重复清洗DNA沉淀一次.
8.1.8将步骤8.1.7离心管中的上清液吸去,将离心管中DNA风干15min.
-80C保存.
8.1.10按照GB/T30744-2014中9.2.1规定,将步骤8.1.9收获的DNA进行纯度测定,满足要求的 DNA用于PCR扩增.