ICS 65.020.01 NY 中华人民共和国农业行业标准 NY/T 4234-2022 芒果品种鉴定 MNP标记法 Identification ofMangoVarieties-MNPmarkermethod 行业标准信息服务 质 正 参考件 2022-11-11发布 发布
NY/T 4234-2022 目次 前言 1范围 2现范性引用文件 3术语和定义 4原理. 5试剂和材料 6仪器设备 7整定步骤 8结果计算分析 附录A(规范性)芒果MNP标记引物
NY/T 4234-2022 前 言 本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定 起草.
本文件的某些内容可能涉及专利,本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由农业农村部农垦局提出.
本文件由农业农村部热带作物及制品标准化技术委员会归口.
本文件起草单位:中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、江汉大学.
本文件主要起草人:李琼、何云、彭海、洪青梅、濮文辉、黄建峰、方治伟、李甜甜、周俊飞、李论、高利芬、 陈利红.
质 文 版 纸 参考件 为 联系电话010-59194426
NY/T 4234-2022 芒果品种鉴定MNP标记法 1范围 本文件描述了应用多核苷酸多态性(MNP)标记法进行芒果(MangiferaindicaLinn)品种鉴定的原 理、试剂和材料、仪器设备、鉴定步骤、结果计算分析.
本文件适用于芒果的原始品种、实质性派生品种和品种真实性的鉴定.
2规范性引用文件 下列文件中的内容通过文中的规范性引用面构成本文件必不可少的条款.
其中,注日期的引用文件.
仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本 文件, GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法 GB/T38551植物品种鉴定MNP标记法 NY/T2440植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南芒果 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件.
3.1 多核苷酸多态性multiple nucleotide polymorphism,MNP 在一段不超过300bp的核苷酸序列中,由多个核苷酸引起的序列多态性.
[来源;GB/T38551.3.1.有修改] 3.2 芒果参考基因组mango reference genome 版本号GCA_011075055.1的芒果基因组序列.
3.3 实质性派生品种essenliai derivedvariety,EDV 由原始品种实质性派生,或者由该原始品种的实质性派生品种派生出来的品种,与原始品种有明显区 别除派生引起的性状差异外,受原始品种的基因型或基因型组合控制的基本性状的表达与原始品种 相同.
3. 4 平均覆盖倍数average coverage [来源;GB/T 38551 3.4] 3.5 检出的标记位点detectedmarker 至少有一个等位基因型有20条及以上测序片段支持的标记位点.
[来源;GB/T 38551.3.5] 4原理 利用多重聚合酶链式反应(PCR)扩增和高通量测序,检测样品基因组上的MNP标记位点,分析测序 数据,获得标记位点的分型结果和鉴定结论.